Κατά την μελέτη για την εγκατάσταση μιας υδροπονικής μονάδας, κεντρική θέση έχει η επιλογή του τύπου του υποστρώματος.
Στην αγορά υπάρχουν αρκετά είδη κατάλληλα για όλες τις καλλιέργειες. Πάντως, κατά την διαδικασία της επιλογής πρέπει να ληφθουν υπόψη το είδος της καλλιέργειας, η συχνότητα επαναφύτευσης, οι απαιτήσεις σε νερό, οι κλιματολογικές συνθήκες και βέβαια το κόστος αγοράς.
Κύριοι τύποι υποστρώματων υδροπονίας :
- Ελαφρόπετρα
- Πετροβαμβακας
- Κοκοφοίνικας
- Περλίτης